近代以来，几乎每隔一段时期，我国便会阶段性从海外搜罗古籍资源。
02年科技部基础性工作专项项目就特意对海外主要藏书机构所藏中医古籍调查，其中有120余种国内失传古籍，最主要的收藏地就是日本。日本到底存有多少早已佚失的孤本古籍，目前尚无完全系统整理。不过自清末以来，有赖中日两方的学者多加考证查找，使得许多早已失传的重要孤本得以重见天日。我大致列了一些书单，包括历史上几次海外孤本重要发现的成果，不全但是可以一窥其中历史渊源。
1、《佚存丛书》《佚存丛书》是日本人林衡编撰的中国久已失散的古籍丛书。成书于1799－1810年间，收入中土久佚的古籍17种，包括汉代《古文孝经》、隋《五行大义》、唐代：《臣轨》、《东书要录》、《两京新记》、《杂咏》、《文馆词林》、后晋《古本蒙求》、宋《感兴诗注》、《泰轩易传》、《玉堂类稿》、《西垣类稿》、《宋景文公集》、《周易新讲义》、元《蒙求》、《唐才子传》。
2、《全唐诗逸》虽是日本人编著唐诗总集，但所收录的大多是日本存传，但国内早已遗失的唐诗，书成年代相当于清乾隆时，约于嘉庆间传入中国。
3、《日本访书志》晚清学者杨守敬可谓是近代中日两国古籍溯源、考证及交流的促进第一人。其在担任驻日大使期间，搜购大量日藏汉籍编著成《日本访书志》，近250种，不仅包括众多古钞本、宋元珍本，也有如《游仙窟》、《冥报记》等久已佚失古籍。
4、《古逸丛书》由黎庶昌与杨守敬共同选编成册，包括26种日藏孤本或珍本汉籍，计古抄9种，宋元旧刊12种，日本历代刊本5种。其中唐《孝经注疏》、南朝梁顾野王《玉篇》残篇、宋《韵镜》、《姓解》等十一本书均为孤本回传。
之后的在日汉籍整理及舶归更多是单本或单类整理，如佛经、中医经典等，都有裴然成果，小说类也可参考《日本东京所见小说书目》（孙楷，1931），在此便不再赘述。
日本现存的中国古籍资源主要收藏于日本内阁文库、东洋文库、静嘉堂文库、大阪大学的怀仁堂等，感兴趣的同学可以直接上他们的官网查询收藏的古籍数据，国内可以访问，不过基本上只能查到书目题录。 最后提供一本日藏孤本资源作为小彩蛋：
《杨东来先生批评西游记》【明】楊納撰藏于日本皇室书库的杂剧版西游记孤本，由是现存时代最早的唯一整剧写唐僧取经故事的戏曲，可以说从此版之后，唐僧取经师徒四人才真正确定下来。此版三徒弟陆续圆寂，最终只唐僧一人活着回到东土，有意思吧~