（一)两者所维护的法律规范的性质不同，
民事公益诉讼所要维护的是行政法律规范，行政公益诉讼所要维护的是民事法律规范；
(二)两者的被告不同，行政公益诉讼以行政机关或其他公权机关为被告，而民事公益诉讼则以民事主体为被告。
行政公益诉讼和民事公益诉讼主要在两个方面的区别：
1、两者所维护的法律规范的性质不同，前者所要维护的是行政法律规范，后者所要维护的是民事法律规范；
2、两者的被告不同，行政公益诉讼以行政机关或其他公权机关为被告，而民事公益诉讼则以民事主体（或私人）为被告。
民事公益诉讼和行政公益诉讼的区别从概念上：两者所维护的法律规范的性质不同，前者所要维护的是行政法律规范，后者所要维护的是民事法律规范；两者的被告不同，行政公益诉讼以行政机关或其他公权机关为被告，而民事公益诉讼则以民事主体为被告。
公益诉讼包括民事公益诉讼和行政公益诉讼。其中民事公益诉讼是指法律规定的机关和有关组织对污染环境、侵害众多消费者合法权益等损害社会公共利益的行为，向人民法院提起的诉讼。
民事诉讼是公民之间、法人之间、其他组织之间及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的诉讼。或者说，民事诉讼是指人民法院、当事人和其他诉讼参与人，在审理民事案件的过程中，所进行的各种诉讼活动，以及由这些活动所产生得各种关系的总和。民事诉讼是诉讼的基本类型之一。
民事公益诉讼产生的法律后果主要有以下几个：
一，可以极大的保护公益和修复受损的公益。
二，对危害公益的行为具有极大的震慑，使的公益侵害人在经济上得到应有的惩罚。
三是会提高社会保护公益意识，自觉保护公益，起到很好的公益保护宣传效果
立案条件，一是有明确的原，被告人，二是有具体的诉讼请求，三是属于夲院管辖。
民事公益诉讼是指行为人的行为造成了国家利益和社会公共利益受损，但又没有具体的权利人来主张权利，而有法律规定的机关或组织代表国家或社会向法院提起诉讼，以维护公共利益。
因此，一般民事公益诉讼均会涉及到重大的环境和资源损害，标的额可能会比较大，从这个角度来说后果还是比较严重的
民事诉讼一般是公开审理和判决，除部分比如涉及秘密的，判决书是可以查询得到。因此，从这个意义上也是有案底的。 如果是被判决有支付款项等义务的，可能会涉及到征信的问题。
民事诉讼在法院是有案卷存档的，但这不是刑事案中的案底，对个人前途无影响。但是个人拒不执行法院判决的，会上不诚信的档案，可能会有影响。
案底是会有的，但是原则上不会对前途有影响，民事官事非常常见，每天都能看见，谁都能遇到，不要有心理负担，真正有影响的应该是行政责任或刑事责任。
即便是刑事公诉，没有审判之前也是没有案底的。
1、两者所维护的法律规范的性质不同，前者所要维护的是行政法律规范，后者所要维护的是民事法律规范；
2、两者的被告不同，行政公益诉讼以行政机关或其他公权机关为被告，而民事公益诉讼则以民事主体（或私人）为被告。
两个不具有可比性的，非常肯定的回答你刑事诉讼的后果严重啊。刑事诉讼是行为触犯了刑法，是要接受刑法的制裁，具体刑罚有拘役、管制、有期徒刑、无期徒刑和死刑等刑罚，这是要剥夺人身自由的，去看守所或监狱接受改造的，孰轻孰重一目了然。